Contexte du recrutement et définition de poste :

Contexte

Les activités humaines ont profondément transformé les paysages modifiant la structure des écosystèmes (Waters et al. 2016; Galetti et al. 2018). En particulier, à la suite des avancées technologiques survenues au milieu du XXᵉ siècle, l’agriculture dans les pays occidentaux a connu une intensification continue, conduisant au développement de monocultures au détriment des zones humides existantes (Perennou et al. 2012; Fluet-Chouinard et al. 2023; Rigal et al. 2023; Mediterranean Wetlands Observatory et al. 2025). Les interactions entre l’être humain et la faune sauvage existent, notamment en raison de la compétition pour l’accès aux habitats et aux ressources (Nyhus 2016). Les problèmes surviennent lorsque les animaux sauvages endommagent les cultures (König et al. 2020). L’augmentation des effectifs de grands oiseaux autrefois menacés tels que flamants, grues, oies et cygnes en Europe entraîne parfois des dommages aux cultures le long de leurs voies de migration.

Les milieux agricoles camarguais constituent pour les flamants comme pour les grues des milieux de substitution aux milieux naturels, présentant une grande prévisibilité d’accessibilité à des ressources très profitables. Certains flamants roses occasionnent des dégâts dans les rizières lors de la mise en eau pour les semis entre avril et juin. Par ailleurs, la présence des grues dans les semis de céréales, en particulier les champs de blé, colza ou couverts végétaux, entre novembre et janvier, occasionne aussi parfois des dégâts. Si les dégâts concernent chaque année une surface de culture réduite, ils sont localement impactants pour l’agriculteur induisant un manque à gagner important.

L’effarouchement par divers moyens est la principale méthode utilisée pour tenter de limiter les incursions. Ces effarouchements font l’objet de mesures dérogatoires mais celles-ci ne sont pas obtenues systématiquement car les méthodes sont souvent peu spécifiques, et que l’efficacité des méthodes d’effarouchement sont mal évalués. De plus, les systèmes d’effarouchement semblent perdre en efficacité au cours des années en raison d’une accoutumance des oiseaux observée vis-à-vis du matériel utilisé.

La Tour du Valat et le Parc naturel régional de Camargue travaillent depuis plusieurs décennies aux côtés des agriculteurs du territoire de Camargue pour limiter les risques d’incursions des flamants roses dans les semis de riz printanier et depuis quelques années sur les incursions des grues dans les milieux agricoles sensibles.

Objectif

Mieux comprendre les déplacements des oiseaux d’eau effarouchés pour les dégâts qu’ils occasionnent afin de mettre en place des pratiques d’effarouchement plus ciblées et plus efficaces.

L’objectif premier est d’analyser les déplacements des flamants roses équipés de GPS lors de la période de semis du riz, en considérant à la fois l’utilisation des habitats naturels et agricoles, ainsi que la réaction des oiseaux aux effarouchements mis en place. En premier l’étude portera sur la Camargue mais elle sera complétée par des analyses dans le delta de l’Ebre en Espagne et le delta du Po en Italie à titre comparatif.

Un autre objectif consiste à analyser les déplacements et utilisation de l’habitat par des espèces non ciblées par l’effarouchement telles que les ibis falcinelles, hérons pourprés, mouettes mélanocéphales, sternes hansels. Enfin, si les données disponibles sont suffisantes, une analyse similaire sera réalisée sur l’utilisation de l’espace par les grues cendrées en hiver en Camargue, en considérant la part de l’utilisation des cultures sensibles aux dégâts par cette espèce et la réaction aux pratiques d’effarouchement.

Mission

Le stage comportera différents volets :

• Collecte des données disponibles auprès des propriétaires de données (chercheurs, agriculteurs, détenteurs de données de télédetection), rédactions de conventions, nettoyage et filtrage ;
• Développement de modèles statistiques et analyses ;
• Rédaction d’un rapport sous forme d’article scientifique pouvant faire l’objet d’une valorisation dans un journal international

Conditions d’accueil

• Lieu de travail : Tour du Valat – Le Sambuc, 13200 Arles, France
• Période du stage : Flexible, entre 1er février et 31 août 2027
• Durée : 6 mois
• Hébergement possible sur site en fonction de la disponibilité: Chambres à partager (2 lits) avec un loyer de 66,70 €/mois (valeur 2026) avec Cuisine et sanitaires en commun
• Véhicule de service fourni en cas de déplacement. Notez qu’il n’est pas prévu de terrain pour le besoin du stage excepté une participation ponctuelle à une tentative de captures de flamants adultes (sous réserve de conditions favorables)
• Stage indemnisé selon dispositions légales : 4€50/heures (valeur 2026)
• Cantine disponible pour les repas du midi – formules classique et végétarien : 3,25€/repas (valeur 2026)

Encadrement

• Jocelyn Champagnon, directeur de recherche à la Tour du Valat

Partenaires et personnes ressources

Le stage implique différents experts, collaborateurs et fournisseurs de nombreux et divers qui pourront être sollicités pour atteindre les objectifs du stage. En particulier :

• Arnaud Béchet, directeur de recherche, Tour du Valat
• Antoine Arnaud, ingénieur de recherche, Tour du Valat
• Thomas Blanchon, technicien de recherche, Tour du Valat
• Anne Vadon, Parc naturel régional de Camargue
• François Clément, Centre Français du Riz / Syndicat des Riziculteurs de France et Filière
• Lorenzo Serra, Istituto Superiore per la Protezione e la Ricerca Ambientale (ISPRA), Italy
• Davide Scridel, DOPPS BirdLife Slovenia
• Antoni Curcó Masip, Parc Natural del Delta de l’Ebre
• Ivar Ojaste, Estonian University of Life Science
• Frédéric Jiguet, Museum National d’Histoire Naturelle
• Olivier Duriez, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive

Candidature

Pour candidater, merci d’adresser un curriculum vitae incluant le nom et contacts de deux personnes référentes, une lettre de motivation, et la copie d’un rapport remis dans le cadre de votre formation -à Jocelyn CHAMPAGNON champagnon@tourduvalat.org -  avant le 12 novembre 2026 8h00, avec dans l’objet du message : «Candidature stage Flamant 2027». Merci de nommer chacun des 3 documents envoyés par mail en débutant par votre nom suivi du descriptif du fichier selon le modèle suivant :

• nom_cv.pdf
• nom_motivation.pdf
• nom_rapport.pdf

Profil recherché :

Profil et compétences requises

• Bac+ 5 Master/Ingénieur
• Connaissances indispensables en statistiques (maitrise de R, connaissances des outils de modélisations, en particulier spatiales)
• Expérience en analyses de données de suivis par balises GPS
• Bonne connaissance de l’écologie des oiseaux
• Compréhension des enjeux, contraintes et systèmes agricoles
• Bonne capacité relationnelle avec les acteurs agricoles, institutionnels, de la conservation et de la recherche
• Bonne capacité d’expression orale et de rédaction écrite en français et en anglais