Contexte du recrutement et définition de poste :

Contexte
Situés au nord de la Gironde et au sud de la Loire, les bassins de la Charente et de la Seudre sont en lien direct avec les pertuis charentais. Par cette position stratégique sur la façade atlantique et la diversité des habitats qu’ils offrent (marais et zones humides, réseau hydrographique dense), ces bassins représentent des territoires d’importance pour la reproduction, la croissance et le développement des poissons migrateurs amphihalins. Ces derniers sont les aloses (grandes et feintes), les lamproies (marines et fluviatiles), les salmonidés (saumon atlantique et truite de mer) et l’anguille. Ces espèces sont dans un mauvais état écologique depuis plusieurs années.
C’est dans ce contexte, que la Cellule Migrateurs des bassins Charente et Seudre (CMCS), composée du rapprochement de CAPENA et de l’Etablissement Public Territorial de Bassin Charente (EPTB Charente), réalise des actions ciblées sur ces espèces afin de mettre en oeuvre des mesures de gestion adaptées visant leur préservation.
Une de ces actions concerne l’évaluation du recrutement estuarien des civelles (jeunes anguilles, Anguilla anguilla) en marais salé de la Seudre. En effet, ce marais de plus de 10 000 ha, représente un habitat d’importance pour l’anguille. La CMCS réalise depuis 2010 des suivis scientifiques sur les anguilles à ses différents stades et notamment au stade juvénile quand elles arrivent depuis l’océan. La CMCS prévoit aussi, en 2027, de suivre le stock en place d’anguilles jaunes dans deux marais doux de Charente-Maritime, le marais de Brouage et celui de Rochefort-Nord. Ces marais sont aussi des réservoirs majoritaires pour cette espèce migratrice. Ces résultats serviront pour l’élaboration d’indicateurs du Tableau de Bord Migrateurs Charente-Seudre (www.migrateurs-charenteseudre). Cet outil a pour but d’évaluer l’état des populations de poissons migrateurs pour permettre aux acteurs du territoire de suivre, comprendre et juger son évolution afin d’orienter les politiques ou les actions. Chaque année les indicateurs sont actualisés et utilisés pour donner un état général à chaque espèce et une tendance évolutive.

Poste et missions
La principale mission sera d’estimer les entrées de civelles sur l’ensemble du marais salé de la Seudre pour la saison 2026-2027 en réalisant un suivi sur le terrain et en travaillant sur un modèle d’estimation grâce aux données récoltées et celles provenant des suivis antérieures (2015, 2017 et 2022). Les paramètres extérieurs pouvant intervenir dans la variation des remontées seront pris en compte comme la température de l’eau, la salinité, les coefficients de marée etc… Pour cela, des pêches seront effectuées et le travail de modélisation sera réalisé au bureau. Les pêches seront réalisées à raison de 2 sorties par mois sur plusieurs sites du marais salé de la Seudre. Le stagiaire sera accompagné sur le terrain. Ce programme est un minimum qui pourra être complété en fonction de l’avancé du suivi.

La seconde mission concernera le suivi des anguilles jaunes en marais doux de Brouage et de Rochefort Nord. Ce suivi aura lieu entre avril et mai 2027 sur 4 à 5 semaines. Le stagiaire devra préparer les pêches (contact avec les propriétaires) et réaliser les pêches sur le terrain au moyen d’engins passifs (verveux). Le stagiaire sera accompagné sur le terrain. Dans la mesure du possible, les données seront analysées courant juin.

Enfin, l’étudiant pourra participer aux autres suivis de la CMCS, avec des collègues de l’EPTB Charente, comme les prospections sur la Charente pour suivre les migrations et reproductions des aloses et lamproies.

Localisation et durée du stage
Le stage se déroulera dans les locaux de CAPENA au Château d’Oléron.
La durée du stage est de 6 mois. Il pourra s’étaler de janvier à juin.

Conditions et rémunération
Indemnités forfaitaires + remboursement des frais de déplacement.
Des déplacements sont à prévoir sur les bassins versants de la Charente et de la Seudre lors des sorties terrain : le permis de conduire est indispensable. Un véhicule de service pourra être utilisé.
Des sorties de nuit pourront être effectuées.

Contact pour cette offre
Eric BUARD
Chargé de mission – poissons migrateurs
CAPENA
Prise de Terdoux 17480 Le Château d’Oléron
Tel : 05 46 47 17 71
Courriel : e.buard@cape-na.fr

Envoyer CV et Lettre de Motivation par mail avant le 15/11/2026

Profil recherché :

Profil candidat
Etudiant en Master 2 dans le domaine des écosystèmes aquatiques.
Autonomie, réactivité, capacité d'initiative, travail de synthèse et de rédaction, sens du contact sont des qualités indispensables pour ce stage.
De bonnes connaissances en dynamique des populations, statistiques (R) et cartographies seront nécessaires.